نتایج بازرسی های اخیر در مورد وضعیت محیط زیست رودخانه های مرزی «ارس» و «کر» حاکی از افزایش سطح آلودگی در این دو رودخانه است .

وزارت محیط زیست و ذخایر طبیعی جمهوری آذربایجان اعلام کرد: این بازرسی ها در ماه مارس – اسفند – و با هدف بررسی سطح آلودگی کر و ارس و نیز رودهای دیگر که به این دو رود بزرگ منطقه ای می ریزند ، انجام گرفت .
بر اساس نتایج بازرسی های انجام گفته میزان مواد بیوژن در رود کر و شاخه های آن بر اثر فاصلاب های شهری و صنعتی گرجستان و ارمنستان چند برابر افزایش یافته است .
همچنین مقدار فنول که از آلاینده های خاص به شمار می رود در آب رود «آقستافا چای» و در سد این رود، واقع در خاک جمهوری آذربایجان به ترتیب ۳ و ۲ برابر بیشتر از حد مجاز است .
همچنین بر اساس نتایج بازرسی های ، دهه دوم ماه مارس میزان فنول ها در رود ارس در منطقه «هورادیز» ۳ برابر ، در مناطق بهرام تپه شاه سون اول واقع در خاک جمهوری آذربایجان دو برابر بیشتر از حد مجاز بوده است .
میزان اکسیژن آب در همه مناطق در حد ۶٫۹۹ تا ۷٫۰۲ میلگرم در لیتر متغیر بوده است .
رود مرزی کر بزرگترین رود سرزمین‌های قفقاز است و این رود به طول حدود هزار و ۵۱۵ کیلومتر است. حدود ۱۷۴ کیلومتر از آن در ترکیه، ۴۳۵ کیلومتر از آن در خاک گرجستان و حدود ۹۰۲ کیلومتر نیز در خاک جمهوری آذربایجان جریان دارد.
ارس رودی بین مرز سه کشور ایران ،آذربایجان و ارمنستان است ، این رود درخاک شهرستان صابرآباد جمهوری آذربایجان به رود کر می پیوندد و کر در اراضی شهرستان نفتچالا به دریای خزر می ریزد .